Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samt1A2BED8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samt1A2BED8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms