Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ism1A2ATD1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ism1A2ATD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms