Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tubb1A2AQ07 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tubb1A2AQ07 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tubb1A2AQ07 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms