Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GabreA2AMW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GabreA2AMW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GabreA2AMW3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms