Protein–RNA interactions for Protein: A2AIX1

Sec16a, Protein transport protein sec16, mousemouse

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec16aA2AIX1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sec16aA2AIX1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec16aA2AIX1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec16aA2AIX1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms