Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cldn34dA2AGU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cldn34dA2AGU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34dA2AGU5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms