Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm884A2A9H6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm884A2A9H6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms