Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf19bA2A7Q9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf19bA2A7Q9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf19bA2A7Q9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf19bA2A7Q9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf19bA2A7Q9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rnf19bA2A7Q9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms