Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sppl2cA2A6C4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sppl2cA2A6C4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms