Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pgap3A2A559 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgap3A2A559 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgap3A2A559 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms