Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam71e1A1L3C1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam71e1A1L3C1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam71e1A1L3C1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms