Protein–RNA interactions for Protein: A1A547

Pglyrp3, Peptidoglycan recognition protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp3A1A547 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pglyrp3A1A547 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pglyrp3A1A547 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pglyrp3A1A547 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms