Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc173A0JLY1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc173A0JLY1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms