Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms