Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RNP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A0U1RNP2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A0U1RNP2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms