Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sycp2lA0A0M3U1B0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms