Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms