Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trbv21A0A0A6YX06 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trbv21A0A0A6YX06 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trbv21A0A0A6YX06 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trbv21A0A0A6YX06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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