Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28919A0A087WP35 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm28919A0A087WP35 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28919A0A087WP35 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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