Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6C4

Trav21-dv12, T cell receptor alpha variable 21-DV12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav21-dv12A0A075B6C4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav21-dv12A0A075B6C4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav21-dv12A0A075B6C4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms