Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q4

Ighv5-12, Immunoglobulin heavy variable 5-12 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ighv5-12A0A075B5Q4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms