Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q0

Ighv5-6, Immunoglobulin heavy variable 5-6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-6A0A075B5Q0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv5-6A0A075B5Q0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ighv5-6A0A075B5Q0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms