Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Hdac5Q9Z2V6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hdac5Q9Z2V6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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