Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Upk1bQ9Z2C6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms