Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ilf3Q9Z1X4 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms