Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ChmQ9QXG2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ChmQ9QXG2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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ChmQ9QXG2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ChmQ9QXG2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ChmQ9QXG2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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