Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms