Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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OtofQ9ESF1 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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OtofQ9ESF1 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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OtofQ9ESF1 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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OtofQ9ESF1 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
OtofQ9ESF1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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