Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn22Q9D7U6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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