Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PrameQ9D4Z5 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrameQ9D4Z5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms