Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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