Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rdm1Q9CQK3 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms