Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Pkp2Q9CQ73 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pkp2Q9CQ73 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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