Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Use1Q9CQ56 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Use1Q9CQ56 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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