Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Plxnb3-201ENSMUST00000002079 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nmd3Q99L48 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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