Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ciao1Q99KN2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms