Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab28Q99KL7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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