Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Apobec3Q99J72 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms