Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms