Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Trappc12Q8K2L8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Trappc12Q8K2L8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Trappc12Q8K2L8 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trappc12Q8K2L8 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Trappc12Q8K2L8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms