Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12377-201ENSMUST00000118656 252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lrit1Q8K099 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lrit1Q8K099 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lrit1Q8K099 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms