Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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