Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms