Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Nup88Q8CEC0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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