Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms