Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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