Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ube2q1Q7TSS2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ube2q1Q7TSS2 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms