Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ssx9Q6XAS3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ssx9Q6XAS3 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms