Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmeff1Q6PFE7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmeff1Q6PFE7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms