Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprdQ64487 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprdQ64487 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprdQ64487 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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PtprdQ64487 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PtprdQ64487 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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